这天中午，太平洋海底基地附近发生了一场地震，从地底下钻出一头怪兽，朝着海底基地走去，这时，怪兽特殊防卫队的警报响了起来，玛娜队员的投影传了过来。
“北野队长，太平洋海底基地附近出现怪兽，现在传送现场画面。”玛娜报告说。
“有没有这头怪兽的数据资料？”北野队长问道。
“有，这头怪兽在sp档案和xio档案里有同种族出现的怪兽，注册代号是深海怪兽古比拉，身高50米，体重35000吨，曾经与初代奥特曼和艾克斯奥特曼交过手。”玛娜报告说。
这时，上野副队长的投影也传到了主控室。
“说一下作战计划，这次作战部门不用出动，特别行动部门出动，消灭怪兽。”上野副队长命令道。
“作战计划听清楚了吗，怪兽形态b型，执行死亡二号命令，tio出动！”北野队长命令道。
“明白！”全体队员回答道。
于是，青川队员和佐和子队员驾驶“鲨鱼”号战斗机出发了，赶赴了现场，潜入了太平洋海底，来到海底基地上空，可是，海底基地已经成为了一片废墟，深海怪兽古比拉早已不见了踪影，青川队员按下了生命探测按钮，可是经过探测，那片废墟已经没有生命的迹象。
“北野队长，我们到达现场，海底基地已经成为了一片废墟，深海怪兽古比拉已经消失不见了，我们进行生命探测，海底基地无一人生还，没有生命的迹象。”青川队员报告说。
听到这里，怪兽特殊防卫队的人员都不由的惋惜。
“知道了，回来吧。”北野队长叹息道。
于是，青川队员和佐和子队员驾驶“鲨鱼”号战斗机返回了怪兽特殊防卫队，这时，玛娜队员的投影传到了主控室。
“玛娜队员，能查出深海怪兽古比拉的具体位置吗？“北野队长问道。
“北野队长，查不出来。”玛娜队员报告说。
“说一下，深海怪兽古比拉随时还会再次出现，大家一定要多加警惕。”北野队长命令道。
时间一分一秒的过去，时间来到了下午，太平洋海岸发生了一场地震，从地底下钻出一头怪兽来，在太平洋海岸大肆的破坏，这时，怪兽特殊防卫队的警报响了起来，这时，玛娜队员的投影传到了主控室。
“北野队长，深海怪兽古比拉出现在太平洋海岸上。”玛娜队员报告说。
这时，上野副队长的投影也传到了主控室。
“还是原先作战计划，作战部门不用协助作战，特别行动部门出动消灭怪兽。”上野副队长命令道。
“作战计划听清楚了吗，怪兽形态b型，执行死亡二号命令，tio出动！”北野队长命令道。
“明白！”全体队员回答道。
于是，天空队员和香奈子队员驾驶“战鹰”号战斗机，青川队员和佐和子队员驾驶“猛虎”号战斗机出发了，赶赴了现场。
“北野队长，目标确认，请求攻击！”天空队员请求道。
“开始攻击！”北野队长命令道。
“明白！”天空队员回答道。
于是，天空队员和香奈子队员驾驶“战鹰”号战斗机，青川队员和佐和子队员驾驶“猛虎”号战斗机用镭射光束向深海怪兽古比拉发动了攻击，深海怪兽古比拉受到了攻击，吼叫了一声，从背上喷出高压水流，一下击中了“战鹰”号战斗机。
“啊，可恶，跳伞！”天空队员叫道。
这时，战斗机机舱打开了，座位把天空队员和香奈子队员弹到了天上，并打开了背包后面的降落伞，天空和香奈子跳伞成功并安全着陆。
“香奈子队员，你一个要小心，我去对付怪兽。”天空队员关心地说。
“你也是。”香奈子队员关心地说。
“雷克斯奥特曼，我们融合吧。”天空队员说。
“好吧，天空队员，我们上！”雷克斯奥特曼说。
于是，天空队员左手拿出奥特读卡器，天空队员面前出现了奥特卡片，右手拿住奥特卡片，插进奥特读卡器里面，奥特读卡器发出五彩光芒。
“雷克斯！”天空队员喊道。
这时，出现了一道五彩光芒，把天空队员与雷克斯奥特曼融合为一体，五彩光芒里面出现了一位蓝红相间的奥特战士，双手握拳，交叉在胸前，旋转着上升，五彩光芒消失后，雷克斯奥特曼一脚踹倒了深海怪兽古比拉。
“天空队员，加油呀！”佐和子高兴地叫道。
雷克斯奥特曼冲向了深海怪兽古比拉，一拳打中了深海怪兽古比拉，深海怪兽古比拉从背上释放出高压水流，击中了雷克斯奥特曼，雷克斯奥特曼一下扑向了深海怪兽古比拉，深海怪兽古比拉一使劲，一下将雷克斯奥特曼从背上甩了下去，摔在了地上，深海怪兽古比拉钻到了地上，从雷克斯奥特曼背后钻出来，一下撞倒了雷克斯奥特曼，深海怪兽古比拉又钻回了地底下去了，从雷克斯奥特曼的背后钻了上来，这回，雷克斯奥特曼一掌劈断了深海怪兽古比拉鼻子上的钻头，雷克斯奥特曼使用了雷克斯投技，一下举起了深海怪兽古比拉，一下将深海怪兽古比拉扔了出去，摔在了地上，雷克斯奥特曼使出了必杀技雷克斯光线，先双手举向天，再右手向右伸展，左手竖着放在胸前，聚集能量，双手呈l型，从右胳膊上释放出五彩光线，一下击中了深海怪兽古比拉，深海怪兽古比拉吼叫了一声，倒在了地上，炸了个粉